Finnmark har det administrative ansvaret for den nordnorske filialen for Kolarctic-sekretariatet, som er programmets kontaktpunkt for norske prosjektutviklere og -partnere i Finnmark, Troms og Nordland.
På samenes i nasjonaldag, 6. februar 2018, signerte fylkesordfører i Finnmark, Ragnhild Vassvik, den formelle avtalen som regulerer hvordan den nordnorske filialen av Kolarctic-sekretariatet opererer. Guvernøren i Lappland, Mika Riipi, signerte avtalen på vegne av EU.
Kolarctic.no melder at avtalen inngås til tross for at det fortsatt er usikkert om Russland vil signere finansieringsavtalen for Kolarctic, som både russiske myndigheter og EU godkjente i Moskva allerede 28. desember 2016.